阳明书院亦称九邑会馆、青原会馆。明正德五年（1510年）余姚王守仁任庐陵知县，在此开坛讲学，从学者甚众。直至嘉靖六年（1527年），王守仁以吉安为中心，往返于吉安、赣州、抚州等地讲学，吉郡名儒邹守益、罗顺钦、聂豹、欧阳德等人交往密切，于每年春、秋两季在青原山讲会，倡良知之学，八方学者聚集青原，成为当时全国讲会中心之一，被誉为“东南邹鲁、西江杏坛”，从而奠定了“江右王学”基础。
明万历年间，吉安九县学者首先在净居寺北侧设置会馆，阳明理学空前兴盛。由于讲学规模大，影响净居寺正常佛事活动，由邹元标、郭子章等人倡议，于万历四十三年（1615年）将讲学之所迁移至翠屏山之阳，待月桥旁时称青原会馆。会馆年久失修，道光十九年（1839年），鹿春如倡建阳明书院于今地。光绪年间废除科举，书院停课。1938年秋至1944年冬，阳明书院曾为国立第十三中高中部校址，后为第36后方医院，建国后为青原山康复医院，是市级重点文物保护单位。
阳明书院座东北朝西南，占地12亩，建筑面积2600平米。分南北两院，中轴线上为门斗、传心堂、五贤祠、魁星阁，前后三进；南院为教工楼、号房、庖湢；北院为核室。
门斗是指大门。传心堂是指先哲讲学的地方。五贤祠是指王学后人举办重要祭祀的建筑，日常供生徒祭吊及春秋两会主讲的地方，五贤是指王守仁、邹守益、罗洪先、聂豹、欧阳德。号房是指考棚，考试的地方。庖湢是厨房和卫生间。核室，一楼为教室、二楼为藏书的地方。阳明书院正面的两幅字“东南邹鲁”“西江杏坛”是当时为全国讲会中心之一的荣誉。邹、鲁是孔子、孟子家乡的雅称，泛指有文化的地方。东南是指阳明书院所在地。杏坛是孔子聚徒讲学的地方，也是指教书育人的地方。西江，指江西。五贤祠二楼的魁星阁。象征着当地文化昌盛，传说魁星降临赐福，让庐陵文运昌盛。魁星是指北斗星中的前四星，主管文运功名禄位。“江右王学”，江右是指江西的别称，等同西江，王学发展有四个区域，浙江的绍兴、江西的吉安、广州的潮州、江苏的泰州，最成熟，最核心的地方在江西吉安。讲学是指对精英讲课，讲会是针对普通的民众。
阳明书院是江西著名的书院之一，是我国著名的理学讲坛，与鹭洲书院、鹅湖书院、白鹿洞书院齐名。